Общество с ограниченной ответственностью (ООО) хотело оспорить в суде конституционность подпункта 3 пункта 3 статьи 170 НК РФ, согласно которому принятые к вычету суммы НДС должны быть восстановлены в случае перечисления сумм оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров, оказания услуг, выполнения работ, передачи имущественных прав. При этом налог нужно восстановить в том же налоговом периоде, в котором суммы НДС подлежат вычету.
Все началось с того, что Федеральная налоговая служба (ФНС) провела камеральную проверку налоговых деклараций за 2 и 3 кварталы 2015 года. На их основе ведомство отказало ООО в возмещении НДС. Основанием для отказа стал тот факт, что налогоплательщик не отразил в декларациях сумму НДС, которая подлежит восстановлению.
В этом случае получается, что НДС к уплате был занижен. Суды трех инстанций и Верховный Суд Российской Федерации в этом споре встали на сторону ФНС. Они указали, что организация должна была восстановить НДС в том налоговом периоде, в котором состоялась поставка предоплаченного товара, а поставщик принял к вычету НДС по ранее выставленным авансовым счетам-фактурам. В Налоговом кодексе не предусматривается перенесение срока восстановления НДС на другой налоговый период.
В ответ на это ООО указало, что первичные учетные документы и счета-фактуры были получены от контрагентов только в 4 квартале 2015 года. Соответственно, на дату отгрузки налогоплательщик не мог заявить к вычету НДС из-за отсутствия документов.
Несмотря на эти факты, Конституционный суд указал, что организационные дефекты в экономической деятельности не могут служить основанием для неисполнения налоговой обязанности. В итоговом постановлении указан отказ в принятии к рассмотрению жалобы ООО.