Согласно подпункту 6 статьи 169 НК РФ, счет-фактуру должен подписать руководитель и главный бухгалтер организации. Также право на это имеют иные лица, уполномоченные на то приказом по организации или доверенностью от имени организации.
Пункт 2 статьи 160 ГК РФ позволяет использовать при совершении сделок факсимильного воспроизведения подписи с помощью средств механического или иного копирования, электронной подписи либо иного аналога собственноручной подписи.
В то же время в НК РФ не предусмотрено использование счетов-фактур, подписанных факсимильной подписью. Такие счета-фактуры признаются законом составленными с нарушением установленного порядка. На их основе нельзя оформить вычет НДС.
Такая же позиция содержится в постановлении Президиума Высшего Арбитражного Суда Российской Федерации от 27 сентября 2011 года № 4134/11.