Обществу с ограниченной ответственностью (ООО) принадлежало два торговых центра. Помещения сдавались в аренду, при этом не абы кому, а подконтрольным арендаторам. Специально для этого было создано еще 18 аффилированных ООО. Те, в свою очередь, использовали освобождение от НДС, поскольку использовали труд инвалидов. При этом сумма субарендной платы превышала арендную во много раз.
В итоге с помощью такого «дробления» бизнеса подконтрольным ООО удавалось применять налоговые спецрежимы (в частности, упрощенную систему налогообложения) и при этом не платить НДС. Благодаря этому основное ООО получало относительно скромный доход, который облагался налогом на прибыль по ставке 20%. Основной же доход от сдачи помещений в аренду поступал мелким ООО и облагался налогом по ставке 6%. Выгода налицо.
Однако ФНС раскрыла эту схему, доначислила недостающие налоги и пени, а также выписала штрафы. Организация попыталась оспорить это решение, однако суды раз за разом отказывали ей.
Так дело и дошло до Верховного суда. Тот тоже отказал в иске. В итоге компания попала на крупную сумму. В общей сложности налоговая доначислила свыше 646 миллионов рублей налогов, 187 миллионов пени и 78 миллионов штрафов.